夜间飞行的航班特点是票价优惠，并且能为旅客免去住宿等麻烦，因而大受出入境旅客的青睐。以前，都是由深圳直飞东南亚，而从3月28日开始，深圳航空公司由深圳直飞吉隆坡（ZH795/6）、新加坡（ZH9011/2）、曼谷（ZH9793/4）三地的航线变更为"经深飞"航线，即西安－深圳－吉隆坡（ZH9085/6）、济南－深圳－新加坡(ZH9059/60)、西安－深圳－曼谷(ZH9089/90)等航线，且这几条航线都是晚上10时后从深圳出发。
自调整后，夜间航班受到出入东南亚的旅客，特别是山东、陕西等地外出务工人员以及珠三角地区旅游团的青睐。据深圳机场边检站统计，四月开始，深圳宝安国际机场经深直飞的夜间航班上座率一直保持在95%左右，出入境客流量较航班调整之前增长了近三成。入境航班上座率更是几近100%。
夜间航班的增多为深圳机场边检站的工作带来了一定难度，该站民警克服困难，积极部署，采取各种有力举措确保夜间航班验放期间口岸畅通、安全。适时加开通道，调配充足警力维持现场秩序并合理引导分流，及时为出入境旅客提供指引服务，开辟"需辅助人员通道"和"团体旅客专用通道"，为老弱病残孕旅客和团体旅客提供便利，缩短侯检时间。